Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfiaQ02780 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms