Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb4Q02738 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms