Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GscQ02591 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GscQ02591 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GscQ02591 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GscQ02591 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GscQ02591 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms