Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcd1Q02242 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms