Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms