Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms