Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RykQ01887 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RykQ01887 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms