Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms