Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms