Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms