Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms