Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd80Q00609 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd80Q00609 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms