Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms