Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms