Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shc1P98083 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms