Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gfra1P97785 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gfra1P97785 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms