Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms