Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
rp9P97762 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
rp9P97762 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
rp9P97762 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
rp9P97762 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
rp9P97762 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
rp9P97762 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
rp9P97762 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
rp9P97762 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
rp9P97762 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
rp9P97762 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
rp9P97762 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
rp9P97762 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
rp9P97762 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
rp9P97762 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms