Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms