Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx1P80205 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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