Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctps1P70698 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctps1P70698 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms