Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms