Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms