Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms