Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms