Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad54lP70270 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms