Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf6P70196 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf6P70196 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms