Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms