Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtnP63089 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtnP63089 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtnP63089 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtnP63089 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtnP63089 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtnP63089 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtnP63089 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtnP63089 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtnP63089 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtnP63089 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtnP63089 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms