Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabrb3P63080 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms