Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbdP63072 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbdP63072 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbdP63072 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UbdP63072 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbdP63072 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbdP63072 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbdP63072 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbdP63072 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbdP63072 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbdP63072 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UbdP63072 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms