Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3P62908 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3P62908 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms