Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbpl1P62340 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms