Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms