Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r1P61809 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms