Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2kP61087 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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