Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms