Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Eif3eP60229 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms