Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms