Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3bP59470 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3bP59470 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms