Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ythdf1P59326 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms