Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms