Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm2P58774 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms