Protein–RNA interactions for Protein: P58681

Tlr7, Toll-like receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr7P58681 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr7P58681 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr7P58681 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr7P58681 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr7P58681 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr7P58681 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr7P58681 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr7P58681 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms