Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpaP58389 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpaP58389 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms