Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dpf3P58269 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms