Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms