Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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