Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp5bP56480 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp5bP56480 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5bP56480 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms