Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irf5P56477 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms